Жакыпова Чынара Шаршеевна 

1992–1993

Какеев Аскар Чукутаевич

1993–1998

Болджурова Ишенкуль Садыковна

2002–2004

Болджурова Ишенкуль Садыковна

27 декабря 2007 - 23 января 2009

Садыков Канат Жалилович

14 июля 2010 - 12 декабря 2014

Сариева Эльвира Кубанычбековна

20 декабря 2014 - 27 октября 2016

Кудайбердиева Гульмира Каримовна

11 ноября 2016 - 4 сентября 2019

Исаков Каныбек Абдуваситович

11 сентября 2019 - 14 октября 2020

Бейшеналиев Алмазбек Бейшеналиевич

14 октября 2020 - 3 октября 2022

Мамбетакунов Уланбек Эсенбеков

3-7 октября 2022 - и.о. министра образования и науки КР

7 октября 2022 - 24 февраля 2023 

Иманалиев Каныбек Капашович

24 февраля - 6 марта 2023 - и.о. министра образования и науки КР

6 марта - 7 сентября 2023

Кендирбаева Догдуркуль Шаршеевна

С 6 октября 2023 г.